1.Воможно ли купить билеты от Уральска до Алматы (только от Уральска справка показывает наличие купе), а сесть в поезд в Илецке? Сохраняются ли в этом случае места, надо ли об этом кого-то уведомлять?
2.Как узнать чей поезд -  российский или казахский.
3.Разъясните по перевозке собак - если выкупается все купе то сколько собак можно провезти? По правилам вроде получается 2 крупных и мелкие в спец.контейнерах, количество не оговаривается. Если выкуплено все купе, то отдельно билет на собаку на покупается?

1. По российским правилам - сесть можно, но если Ваши места уже будут заняты пассажирами с предыдущих станций (от Уральска до Илецка), то Вам придется довольствоваться теми, что будут свободными. Это, правда, на российских ж.д. На казахских может быть по-другому.
2. Можно посмотреть справку "Экспресс" на этом сайте. Вроде там указывается дорога формирования.