вот что удалось найти сразу:
"Проезд в Калининград транзитом через Литву
Проезд в Калининград транзитом через территорию Литвы граждан СНГ, а также граждан России в вагонах формирования дорог стран СНГ осуществляется только при наличии литовской транзитной визы.
Проезд в поездах №№:
29/30 Москва-Калининград
149/150 Москва-Калининград
79/80 Санкт-Петербург-Калининград
259/260 Анапа-Калининград
525/526 Челябинск-Калининград
и в беспересадочном вагоне Мурманск-Калининград осуществляется по следующим правилам.
Оформление билетов осуществляется только в кассах, оборудованных терминалами "Экспресс" и только при личной явке пассажира (за исключением детей до 14 лет вместо которых явиться в кассу должны их родители). В г. Москве оформление билетов производится только в специализированных кассах вокзалов и Московского железнодорожного агенства.
При оформлении билета пассажир должен сказать кассиру, есть ли у него документ, дающтй право на проезд через территорию Литвы (литовская виза, вид на жительство, разрешение на многократный транзит) или нет. В случае утвердительного ответа пассажир расписывается на специальном бланке в том, что о необходимости наличия документа, разрешающий транзитный проезд через Литву он проинформирован.
В случае, если разрешения на транзит через территорию Литвы у пассажира нет, вступает в действие механизм оформления и выдачи специального одноразового Упрощенного проездного документана железной дороге. Данные пассажира передаются в Литовское консульство, которое в течение 26 часов дает ответ, возражает ли оно против проезда пассажира по ее территории или нет. О результате пассажир сможет узнать в любой кассе дальнего следования или билетной кассе. В случае отказа Литвы в разрешении на транзит МПС также уведомляет пассажира по телефону, указанному им при покупке билета. При отказе в транзите пассажир имеет право сдать свой билет в кассу. При этом стоимость билета возвращается полностью, включая комиссионные сборы. При положительном ответе консульства Литвы пассажир получает упрощенный документ на транзит непосредственно в поезде. Переоформление билетов пассажирам, нуждающимся в получении упрощенного документа на транзит, не производится.
Детям до 14 лет проездные документы оформляются по собственному загранпаспорту или загранпаспорту родителя, в чьей документ от вписан, при наличии вклеенной фотографии. По свидетельству о рождении проездные билеты в Калининград не оформляются. Детям младше 5 лет оформляется бесплатный проездной документ без занятия отдельного места."
. Но что-то не пойму, по каким документам оформляется билет(будет же вопрос про российский паспорт 
).
.